长沙生态动物园在城轨站E出口。

因为官方网站和地图上都标注了E出口作为前往生态动物园的出口，并且在出口附近也有指示牌提示。

如果需要前往生态动物园的游客可以在E出口下车，出站后根据指示牌前往生态动物园。