《躯壳》的结局是主角草薙素子获得了自由，她决定脱离政府机构“公安9课”，与联合外星人远走高飞。同时，她意识到自己与另一个存在所交换的“灵魂”，也有机会在这个过程中获得自由。整个故事在墨西哥边境幕落，给人留下了许多思考。电影与原著重要的区别在于，电影在深入探讨生命、自我等意义背后，留给观众了追求自由的想象空间。