公对公转款如果和开票金额对不上，那要赶紧咨询客户是转款转少了还是发票开少了或者开多了。一般财务的做法都是把已经开好的发票作废，哪怕专用发票跨月需要红字冲掉，然后再开具正确发票。一般不会把款项退回再让客户重新打款的。