大溪地染色珠和天然色珍珠的区别主要表现在颜色、瑕疵、大小和稳定性等方面。
颜色：染色珍珠的颜色一般较为均匀，表面颜色为纯黑色，而天然大溪地黑珍珠的颜色非纯黑，而是有轻微彩虹样的闪光的深蓝黑色，或带有青铜色调的黑色。此外，天然珍珠的颜色从内部透出，比较柔和灵动，有层次感，而染色珍珠的颜色浮于表面，比较呆板。
瑕疵：天然珍珠的瑕疵处色泽较浅，而染色珍珠虽然为努力营造天然晕彩而添加不同的金属色调，但颜色分布容易不均匀，尤其会在珍珠的孔洞及瑕疵处浓集成边界较清晰的色斑。
大小：大溪地黑珍珠颗粒较大，尺寸一般在8-14毫米之间，小部分会超过17毫米，被视作罕见珍品。一般来说，黑珍珠颗粒越大，价格越高。
稳定性：天然珍珠的颜色从内部透出，长期佩戴颜色会变得更为柔和灵动；染色珍珠的颜色浮于表面，长期佩戴颜色可能会变得不均匀。