宅基地复耕的补偿一般归集体经济组织所有，补偿款由集体经济组织负责管理和分配。根据《土地管理法》规定，土地补偿费归农村集体经济组织所有；地上附着物及青苗补偿费归地上附着物及青苗的所有者所有。因此，宅基地上的房屋是附着物，补偿归所有者拥有，而农村中的宅基地补偿款归农村集体经济组织所有。

在宅基地复耕过程中，如果需要征收土地，征收补偿款一般由政府支付给农村集体经济组织，再由集体经济组织根据实际情况分配给被征收土地的农户。如果农户对宅基地复耕和征收补偿有疑问或纠纷，可以向当地政府或相关部门咨询或寻求法律援助。