马岛獴的生殖过程和其他哺乳动物类似，雄性马岛獴通过阴茎将精子注入雌性马岛獴体内，雌性马岛獴受精卵在子宫内发育，最终诞下幼崽。马岛獴的交配季节是在每年的11月和12月期间，雄性马岛獴通过打斗和争夺领地的方式来取得繁殖权。这种动物一般会生下一到三个幼崽，幼崽会在母亲的体内孵化并吸收营养。出生后幼崽会待在母亲身边长大，到达成年后开始独立生活。