对于收到的农产品3%专票，可以通过电子发票服务平台进行勾选。具体步骤如下：

进入电子发票服务平台，选择“抵扣勾选”模块。

在抵扣勾选模块中，选择“发票抵扣勾选”，然后选择开票日期范围和发票类型。

在查询结果中，选择需要勾选的发票，点击“提交”按钮。

在弹出的提示框中，确认勾选信息，点击“确定”按钮，完成勾选操作。

需要注意的是，如果发票状态为“已勾选”，则需要在“不抵扣勾选”模块中进行撤销勾选操作。同时，对于农产品发票等特定业务类型的发票，需要进行特定的处理和操作。可以查看电子发票服务平台的操作指南或者联系平台客服获取更多帮助。