南城北部学校和南部学校是两所不同的学校，它们之间存在一些区别。

南城北部学校是位于中国东莞市国际商务区北部的一所高标准建设的九年制公办学校。它占地面积38564平方米，建筑面积112587平方米，总投资约8.5亿元。该学校计划设立中小学共87个班，提供3615个优质学位。学校邀请了具有国际学校设计经验的团队领衔设计，建筑体现了“空间服务课程”和“资源靠近学生”两大原则，并按照教学区、功能区、运动区、生活区、生态休闲区、交通区等六大区域进行布局。

而南部学校则是韩国的一所4年制的私立综合大学，名为南部大学。它成立于1998年，以崇仰上帝、尊敬人类、热爱国家的建学理念而创立。学校的目标是进行道义教育、协同教育和职业教育，并以其教育、就业、研究等方面的优秀性得到了各方面的承认。南部大学设有本科学院和研究生学院，并在中国教育部可认证学历的韩国大学名单中。

综上所述，南城北部学校和南部学校的主要区别在于它们所在的地理位置、办学性质、办学层次以及建筑设计理念等方面。