长春6号线不能站内换乘主要是因为设计时没有考虑到站台之间相互连接的条件和限制。在地形和轨道布局等方面，6号线的不同车站之间存在着明显的高低差和转弯半径不一致等局限条件，导致在车站之间建设站内换乘通道困难重重。

此外，站内换乘也需要考虑到安全和运营的因素，如如何管理换乘通道的出入口和安置安全疏散措施等，这些都需要多方面进行考虑和权衡。