索马里海盗旗帜只有一种。索马里海盗的旗帜是黑色的，旗面上有一个骷髅加上两根交叉骨头的图案，被称为"骷髅旗"，也被称为"海盗旗"。这面旗帜是用来恐吓和警告其他船只，表明他们是海盗，如果对方不进行配合，他们就会对对方进行攻击和抢劫。