艾伦变成蓝眼睛是因为他成功地继承了始祖巨人以及亚当与夏娃的遗传基因。始祖巨人是一种具有强大力量和能力的生物，而亚当与夏娃是人类的祖先之一。继承这样的基因，艾伦的眼睛发生了变化，成为了蓝色，也表明着他已经具备了巨人的力量和能力。

此外，蓝色也是一种象征着思考和知识的颜色，这或许也暗示着艾伦之后会有更多的思考和决策。