这个问题需要具体分析，不能一概而论。

根据《中华人民共和国治安管理处罚法》第二十六条的规定，如果盗窃的数量在五百棵以下，由地方公安机关处理；如果数量在五百棵及以上，属于刑事犯罪，由林业公安机关和公安机关合作处理。

因此，如果基本农田种的树的盗窃数量在五百棵及以上，属于林业公安和地方公安双管辖。

如果数量在五百棵以下，则由地方公安机关处理。

值得注意的是，不同地区有不同的规定和实践，需要具体结合当地的法律法规和实际情况来判断，以便妥善处理此类案件。