县城海拔232米。

元阳县地处哀牢山中山峡谷小区南部，全境为山区。地势由西北向东南倾斜。由于长期受红河、藤条江水系的侵蚀、切割，地貌呈现出中部突起，南北两侧低下，北面山地多为羽状横向峡谷，南面坡形多为箕状，全县地形可概括为“两山两谷三面坡，一江一河万级田”。最低海拔144米，最高海拔2939.6米。红河流经北境，夕欧河、乌拉河、者那河、丫多河等27条大小支流流经境内。年均温16.4℃，年均降水量1407毫米。盛产香蕉、菠萝、荔枝等水果，特产鲁沙梨。矿藏有铅、铁、铜、金、独居石等。晋（宁）思（茅）、红（河）元（阳）公路穿境。