氯化血红素和卟啉铁在来源、化学结构和生理功能上存在明显的区别。

首先，氯化血红素主要存在于哺乳动物的红细胞中，是血红蛋白的主要成分。它由一个亚铁离子与卟啉环结合形成，并带有正电荷。在动物体内，氯化血红素发挥着输送氧气的关键作用。

而卟啉铁则是由卟啉环与亚铁离子结合形成的化合物，是植物和某些微生物体内合成的一种天然色素。在植物和微生物中，卟啉铁参与光合作用和生长等重要生理过程。

其次，两者的化学结构也有所不同。血红素是一个由四个吡咯基组成的环状结构，中心结合了一个铁离子。这个铁离子与其他的分子或离子有较强的相互作用，使得血红素具有传递氧气的能力。而卟啉铁的化学结构则是在卟啉环的基础上添加了铁离子，形成了一种更为稳定的化合物。

最后，两者的生理功能也不同。氯化血红素主要负责输送氧气，参与动物体内的氧化还原反应，保持机体的正常生理功能。而卟啉铁在植物和微生物中则参与光合作用和生长等过程，有助于植物和微生物的生长和发展。

总结来说，氯化血红素和卟啉铁虽然都含有铁离子和卟啉环结构，但由于来源、化学结构和生理功能上的差异，两者具有不同的特性和用途。