根据民事诉讼法，瑕疵证据即“未经合法渠道获得，或者虽经合法渠道获得但违反法律规定而收集的证据，不能作为认定事实的根据”。如涉及犯罪，应以刑法的规定为准。

在民事诉讼中，当当事人以瑕疵证据作为证明，对方当事人可以提出抗辩，如瑕疵证据确实存在，应将其排除。

如果法院发现当事人提交的证据明显存在瑕疵，应当进行质证，并最终根据法律规定作出判决，保证审理公正。