有权管辖走私犯罪案件的机关是海关侦查走私犯罪公安机关。根据刑诉法的规定,对刑事案件的侦查、拘留、执行逮捕、预审,由公安机关负责。
公安机关对于报案、控告、举报和自首的材料,应当按照管辖范围,迅速进行审查,认为有犯罪事实需要追究刑事责任的时候,应当立案。