一般情况下是在出院结账前只要能登记上新农合是都可以报销的。但是报销比例可能会有所不同，电子转诊与纸质转诊报销的比例会相差一部分比率。

农村合作医疗报销的话，不管住院几天，只要你住院了，而且达到一定的金额就给报销，如果不达到一定的金额是不给报销的