建房被邻居恶意投诉，首先要冷静处理，了解投诉的细节和情况，以及对方的诉求。如果对方的投诉没有依据，可以向主管部门进行申诉并寻求法律协助。如果有问题需要改进，可以与邻居协商解决，或者接受主管部门的指导进行改正。在处理过程中，要避免与邻居产生激烈冲突，保持沟通和解决问题的积极态度。