基础保证金是商家入驻京东平台时必须缴纳的一笔固定费用，它主要用于确保商家能够遵守平台的规则和政策，维护平台的正常运营秩序。这笔费用在商家入驻时一次性缴纳，并在商家退出平台时根据相关规定进行退还。
而店铺保证金则更侧重于对商家在平台上的经营行为的约束和保障。店铺保证金通常是根据店铺的销售规模、信誉等级等因素进行浮动调整，如果商家在经营过程中出现违规行为或者未能履行相关义务，平台有权扣除相应的店铺保证金作为惩罚。
简单来说，基础保证金更像是入驻京东平台的“门槛费”，而店铺保证金则是商家在平台上持续经营时需要遵守的“规则费”。两者共同构成了京东平台对商家的管理和约束机制，有助于维护平台的健康发展和消费者的合法权益。