1、功能不同：虽然两种收款码都可以收钱，然而支持付费方式是不同的，商家收款码支持任意类型的银行卡；个体收款码不支持信用卡，只可以用借记卡或零钱余额；

2、费率不同：商家收款码需要商家自行申请，通过后一般标准费率是0.6%，之后可以申请调低让其费率控制在0.3%-0.6%，但是之后提现是不会再收取费用的。而个体收款码申请的时候免费，但每次提现都会收取0.1%的手续费，且限额是20万；

3、提现方式不同：商家的收款码收到的钱会先到商家个人账户，第二天然后自动提现到绑定的银行卡中，申请的时候也需要递交相关的商家的资质。而个体收款码收到的钱会直接存入到零钱余额当中，不会自动提现而需要手动去操作。