香港研究生和澳门研究生存在一些区别。

首先，香港有多所世界知名大学，研究生能够选择更多的学校和专业；而澳门只有澳门科技大学一所公立大学。

其次，香港研究生的学制一般为1-2年，而澳门的研究生学制则一般为2-3年，存在时间上的差异。

此外，香港的研究生教育更加国际化，有更多的外籍教授和国际化的课程设置；而澳门研究生则相对更加侧重本地经济、文化、教育方面的课程设置。

综上所述，香港研究生和澳门研究生在学校选择、学制、课程设置等方面存在一定差异。