对于自建房三层，需要预埋水管的数量会根据需求而定。一般来说，主要需要预埋的水管包括自来水、排水、热水以及灭火水源等。而针对不同楼层的水管需求也会有所不同，比如说第一层需要更多的排水管道，而上层则需要更多的热水管道。因此，在规划预埋水管时，需要根据实际需求和楼层设计细节来确定具体数量。